A Universidade de Pernambuco é constituída pelas seguintes Pró-Reitorias:
- PROADMI - Pró-Reitoria de Administração e Finanças
- PRODEP - Pró-Reitoria de Desenvolvimento de Pessoas
- PROEC - Pró-Reitoria de Extensão e Cultura
- PROGRAD - Pró-Reitoria de Graduação
- PROPEGi - Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa e Inovação